Das Institut ist Mitherausgeber des bei De Gruyter Oldenbourg erscheinenden Jahrbuchs „Danubiana Carpathica. Jahrbuch für Geschichte und Kultur in den deutschen Siedlungsgebieten Südosteuropas.“ Dieses Jahrbuch setzt das „Südostdeutsche Archiv“ 1 (1957) – 47 (2004) fort.